A Bacia do São Francisco é muito rica em minerais, dispondo de jazidas, desde ouro até calcáreo, passando por minério de ferro e outros.
Não podemos nos esquecer que a região de minério de ferro do Estado de Minas Gerais se acha nos vales dos rios das Velhas e do Paraopeba, dois afluentes do São Francisco. O vale do Paracatu dispõe de minas e de ouro, cuja exploração é feita por firma inglesa.
No município de Vargem Bonita, do leito do São Francisco, recém saída do Parque Nacional da Serra da Canastra, produz diamante, e ali existe uma Cooperativa que congrega mais de 250 garimpeiros.
Grandes partes de gipsita (gesso) para a indústria de cimento saíram de Municípios do Vale, como Espírito Santo em Pernambuco, Montes Claros em Minas Gerais e Campo Formoso na Bahia.
O rio das Velhas, o Abaeté e o Indaiá, são ricos em ouro e diamantes. Existem levantadas no Vale do São Francisco jazidas dos seguintes minérios metálicos: Prata, Ouro, Cromo, Cobre, Ferro, Manganês, Chumbo, Titânio e Zinco.
Não metálicos: Algamatolito, Amianto, Ardósia, Argila, Calcário, Granita, Diamante, Dolomita, Gipsita, Mármore, Ocre, Fósforo, Quartzo, Enxofre, Talco e Grafita.
São grandes as reservas de Zinco, Enxofre, Algamatolito e Chumbo, das quais detêm 100% das reservas nacionais.
40 a 60% das reservas nacionais de Cromo, Ardósia e Diamante.
20 a 40% das reservas nacionais de Ferro, Calcário, Gipsita, Ocre, Quartzo, Ouro e Mármore.
10 a 20% das reservas nacionais de Cobre, Manganês, Fertilizantes Fosfatados e Argila.
5 a 10% das reservas nacionais de Titânio, Amianto, Cianita, Magnésio, Dolomita e Sílex, estão na Bacia do São Francisco.